Vörur

Við höfum nýlega greint frá því að pýren núkleótíð sé helst sett inn á móti abasískum stað, 3'-T týmíndímer, og flestum óskemmdum basum með ger DNA pólýmerasa eta (pol eta).Vegna þess að pýren er óskautuð sameind án H-tengjagetu, er óvenjulega mikil skilvirkni dPMP innsetningar rakin til yfirburða stafsetningarhæfileika þess og undirstrikar mikilvægi þess að stafla basa við val á núkleótíðum eftir pol eta.Til að kanna hlutverk H-tengis og rúmfræði basapars í vali á núkleótíðum eftir pol eta, ákváðum við innsetningarvirkni basabreyttu núkleótíðanna 2,6-díamínópúríns, 2-amínópúríns, 6-klórpúríns og inósíns sem myndi búðu til mismunandi fjölda H-tengja með sniðmátsgrunninum eftir rúmfræði grunnparsins.Watson-Crick basapörun virðist gegna mikilvægu hlutverki í vali á núkleótíðhliðstæðum til innsetningar á móti C og T eins og sést af lækkun á hlutfallslegri innsetningarvirkni með fækkun á fjölda Watson-Crick H-tengja og aukningu á fjölda víxlverkana gjafa-gjafa og viðtakanda-viðtakanda.Sértækni innsetningar núkleótíða er meiri á móti 5'-T en 3'-T týmíndímersins, í samræmi við fyrri vinnu sem bendir til þess að 5'-T sé haldið stífara en 3'-T.Ennfremur virðist innsetning A á móti báðum T-um dimersins vera miðlað af Watson-Crick basapörun en ekki af Hoogsteen basapörun byggt á næstum því eins innsetningarhagkvæmni A og 7-deaza-A, en sá síðarnefndi skortir H- tengingargeta við N7.Hlutfallsleg skilvirkni fyrir innsetningu núkleótíða sem geta myndað Watson-Crick basapör er sambærileg við Klenow brotið, en Klenow brotið greinir sterkari mismunun, í samræmi við meiri lögunarvalhæfni þess.Þessar niðurstöður undirstrika mikilvægi H-tengis og Watson-Crick basapars rúmfræði við val á núkleótíðum með bæði pol eta og Klen ow brotinu, og minna hlutverki lögunarvals við innsetningu með pol eta vegna þess að það er opnara og minna. takmarkaður virkur staður.